В его блоге появилась следующая надпись: "Пишу по просьбе Алексея. Он в психушке, с сегодняшнего дня. Пошел в суд, а попал в психушку. Это уже после одного добровольного обследования. Но результаты того обследования явно кого-то не обрадовали, поэтому врачи рекомендовали обследовать более тщательно. Вот и забрали прямо из зала суда. Мне удалось забрать у него фотоаппарат и личные документы. Забрали на 30 дней, не обращая внимания на то, что он опекун 87-летней матери. С сегодняшнего дня Алексей объявил голодовку до конца обследования. Вера".

В отношении Манникова в 2006 году было возбуждено уголовное дело по обвинению в неподчинении остановившим его автомобиль для проверки документов сотрудникам ГАИ и их оскорблению, пишет "Росбалт".

Мананников свою вину не признает. Он связывает задержание его автомобиля с "давлением", которое на него якобы оказывалось со стороны органов ФСБ. Экс-сенатор утверждает, что сотрудники ГАИ задержали его перед пресс-конференцией, на которой он планировал сделать "ряд громких заявлений" по одному из уголовных дел, расследование которых велось ФСБ.

В начале 1990-х годов Мананников считался одним из самых ярких новосибирских политиков-демократов. До перестройки он отбыл трехлетний срок за "антисоветчину". В 1990 году Мананников был избран депутатом РСФСР и в 1993-1995 годах входил в состав Совета Федерации от Новосибирской области. В последнее время руководит правозащитным фондом "Вена-89".